Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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