Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tlr5Q9JLF7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tlr5Q9JLF7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr5Q9JLF7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr5Q9JLF7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr5Q9JLF7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms