Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
OtofQ9ESF1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms