Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Usp29Q9ES63 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Usp29Q9ES63 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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