Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms