Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms