Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fundc1Q9DB70 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms