Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med27Q9DB40 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms