Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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