Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms