Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nudt21Q9CQF3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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