Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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Chmp3Q9CQ10 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms