Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms