Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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