Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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