Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf144aQ925F3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf144aQ925F3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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