Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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