Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krt5Q922U2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krt5Q922U2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms