Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms