Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cabp4Q8VHC5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms