Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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