Protein–RNA interactions for Protein: Q8R149

Bud13, BUD13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud13Q8R149 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bud13Q8R149 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms