Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms