Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn3Q8K045 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms