Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ercc8Q8CFD5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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