Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms