Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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