Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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