Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc187Q8C5V8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc187Q8C5V8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc187Q8C5V8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc187Q8C5V8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc187Q8C5V8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc187Q8C5V8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc187Q8C5V8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc187Q8C5V8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms