Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms