Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms