Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec22cQ8BXT9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms