Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtpaQ8BWP5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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