Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx17Q8BVL3 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx17Q8BVL3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms