Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8BGC1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8BGC1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms