Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 403.6 ms