Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ttc29Q80VM3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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