Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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