Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6aQ78XR0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms