Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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