Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmeff1Q6PFE7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms