Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf1Q6PDM2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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