Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms