Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms