Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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