Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop58Q6DFW4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms