Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms