Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf280dQ68FE8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf280dQ68FE8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf280dQ68FE8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf280dQ68FE8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Znf280dQ68FE8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Znf280dQ68FE8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Znf280dQ68FE8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf280dQ68FE8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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