Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ccdc18Q640L5 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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