Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtmQ62388 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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AtmQ62388 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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